Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccl7Q03366 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccl7Q03366 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccl7Q03366 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccl7Q03366 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccl7Q03366 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccl7Q03366 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccl7Q03366 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccl7Q03366 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccl7Q03366 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccl7Q03366 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccl7Q03366 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccl7Q03366 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccl7Q03366 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccl7Q03366 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccl7Q03366 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccl7Q03366 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccl7Q03366 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccl7Q03366 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccl7Q03366 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccl7Q03366 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccl7Q03366 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccl7Q03366 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccl7Q03366 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccl7Q03366 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccl7Q03366 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccl7Q03366 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccl7Q03366 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccl7Q03366 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccl7Q03366 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccl7Q03366 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccl7Q03366 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccl7Q03366 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccl7Q03366 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccl7Q03366 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccl7Q03366 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccl7Q03366 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccl7Q03366 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccl7Q03366 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccl7Q03366 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccl7Q03366 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccl7Q03366 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccl7Q03366 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccl7Q03366 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccl7Q03366 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccl7Q03366 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccl7Q03366 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccl7Q03366 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccl7Q03366 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccl7Q03366 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccl7Q03366 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccl7Q03366 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccl7Q03366 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms