Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms