Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cacna1sQ02789 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cacna1sQ02789 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cacna1sQ02789 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cacna1sQ02789 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cacna1sQ02789 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Cacna1sQ02789 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Cacna1sQ02789 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cacna1sQ02789 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Cacna1sQ02789 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cacna1sQ02789 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cacna1sQ02789 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Cacna1sQ02789 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cacna1sQ02789 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cacna1sQ02789 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cacna1sQ02789 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cacna1sQ02789 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cacna1sQ02789 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cacna1sQ02789 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cacna1sQ02789 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cacna1sQ02789 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Cacna1sQ02789 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cacna1sQ02789 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cacna1sQ02789 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cacna1sQ02789 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cacna1sQ02789 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Cacna1sQ02789 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cacna1sQ02789 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cacna1sQ02789 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cacna1sQ02789 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cacna1sQ02789 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cacna1sQ02789 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cacna1sQ02789 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cacna1sQ02789 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cacna1sQ02789 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cacna1sQ02789 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cacna1sQ02789 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cacna1sQ02789 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cacna1sQ02789 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cacna1sQ02789 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cacna1sQ02789 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cacna1sQ02789 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cacna1sQ02789 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cacna1sQ02789 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Cacna1sQ02789 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cacna1sQ02789 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Cacna1sQ02789 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cacna1sQ02789 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cacna1sQ02789 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Cacna1sQ02789 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cacna1sQ02789 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cacna1sQ02789 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cacna1sQ02789 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cacna1sQ02789 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cacna1sQ02789 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Cacna1sQ02789 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cacna1sQ02789 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cacna1sQ02789 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cacna1sQ02789 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cacna1sQ02789 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Cacna1sQ02789 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cacna1sQ02789 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cacna1sQ02789 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cacna1sQ02789 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cacna1sQ02789 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cacna1sQ02789 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cacna1sQ02789 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cacna1sQ02789 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cacna1sQ02789 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cacna1sQ02789 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cacna1sQ02789 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cacna1sQ02789 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cacna1sQ02789 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cacna1sQ02789 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cacna1sQ02789 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cacna1sQ02789 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cacna1sQ02789 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cacna1sQ02789 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cacna1sQ02789 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cacna1sQ02789 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cacna1sQ02789 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cacna1sQ02789 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cacna1sQ02789 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cacna1sQ02789 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cacna1sQ02789 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cacna1sQ02789 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cacna1sQ02789 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cacna1sQ02789 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cacna1sQ02789 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cacna1sQ02789 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cacna1sQ02789 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cacna1sQ02789 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cacna1sQ02789 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cacna1sQ02789 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cacna1sQ02789 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cacna1sQ02789 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cacna1sQ02789 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cacna1sQ02789 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cacna1sQ02789 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cacna1sQ02789 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms