Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Col6a2Q02788 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms