Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NfiaQ02780 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NfiaQ02780 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NfiaQ02780 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NfiaQ02780 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NfiaQ02780 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NfiaQ02780 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NfiaQ02780 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NfiaQ02780 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NfiaQ02780 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NfiaQ02780 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NfiaQ02780 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NfiaQ02780 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NfiaQ02780 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NfiaQ02780 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NfiaQ02780 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
NfiaQ02780 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NfiaQ02780 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
NfiaQ02780 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NfiaQ02780 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NfiaQ02780 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NfiaQ02780 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NfiaQ02780 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
NfiaQ02780 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NfiaQ02780 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NfiaQ02780 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
NfiaQ02780 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NfiaQ02780 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
NfiaQ02780 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NfiaQ02780 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NfiaQ02780 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NfiaQ02780 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NfiaQ02780 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NfiaQ02780 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NfiaQ02780 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NfiaQ02780 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NfiaQ02780 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
NfiaQ02780 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
NfiaQ02780 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NfiaQ02780 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NfiaQ02780 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NfiaQ02780 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NfiaQ02780 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NfiaQ02780 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NfiaQ02780 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NfiaQ02780 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NfiaQ02780 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NfiaQ02780 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NfiaQ02780 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NfiaQ02780 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NfiaQ02780 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NfiaQ02780 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NfiaQ02780 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
NfiaQ02780 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NfiaQ02780 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NfiaQ02780 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
NfiaQ02780 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NfiaQ02780 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NfiaQ02780 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NfiaQ02780 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NfiaQ02780 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NfiaQ02780 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NfiaQ02780 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NfiaQ02780 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NfiaQ02780 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NfiaQ02780 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NfiaQ02780 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NfiaQ02780 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
NfiaQ02780 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NfiaQ02780 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NfiaQ02780 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NfiaQ02780 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NfiaQ02780 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NfiaQ02780 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NfiaQ02780 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NfiaQ02780 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NfiaQ02780 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NfiaQ02780 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NfiaQ02780 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NfiaQ02780 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NfiaQ02780 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NfiaQ02780 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NfiaQ02780 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NfiaQ02780 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
NfiaQ02780 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
NfiaQ02780 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NfiaQ02780 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NfiaQ02780 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NfiaQ02780 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NfiaQ02780 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NfiaQ02780 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
NfiaQ02780 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NfiaQ02780 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NfiaQ02780 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NfiaQ02780 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NfiaQ02780 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NfiaQ02780 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NfiaQ02780 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NfiaQ02780 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NfiaQ02780 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms