Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GscQ02591 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GscQ02591 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GscQ02591 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GscQ02591 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GscQ02591 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GscQ02591 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GscQ02591 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GscQ02591 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GscQ02591 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GscQ02591 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GscQ02591 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GscQ02591 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GscQ02591 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GscQ02591 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GscQ02591 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GscQ02591 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GscQ02591 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GscQ02591 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GscQ02591 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GscQ02591 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GscQ02591 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GscQ02591 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GscQ02591 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GscQ02591 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GscQ02591 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GscQ02591 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GscQ02591 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GscQ02591 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GscQ02591 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GscQ02591 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GscQ02591 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GscQ02591 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GscQ02591 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GscQ02591 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GscQ02591 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GscQ02591 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GscQ02591 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GscQ02591 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GscQ02591 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
GscQ02591 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GscQ02591 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GscQ02591 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GscQ02591 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GscQ02591 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GscQ02591 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GscQ02591 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GscQ02591 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GscQ02591 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GscQ02591 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GscQ02591 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GscQ02591 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GscQ02591 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GscQ02591 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GscQ02591 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GscQ02591 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GscQ02591 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GscQ02591 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GscQ02591 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GscQ02591 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GscQ02591 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GscQ02591 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GscQ02591 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GscQ02591 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GscQ02591 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GscQ02591 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GscQ02591 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GscQ02591 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GscQ02591 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GscQ02591 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GscQ02591 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GscQ02591 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GscQ02591 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GscQ02591 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GscQ02591 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GscQ02591 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GscQ02591 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GscQ02591 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GscQ02591 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GscQ02591 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GscQ02591 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GscQ02591 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GscQ02591 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GscQ02591 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GscQ02591 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GscQ02591 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GscQ02591 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GscQ02591 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GscQ02591 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GscQ02591 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GscQ02591 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GscQ02591 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GscQ02591 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GscQ02591 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GscQ02591 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GscQ02591 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GscQ02591 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GscQ02591 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GscQ02591 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GscQ02591 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms