Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms