Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nme2Q01768 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms