Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbp1Q01514 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbp1Q01514 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbp1Q01514 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbp1Q01514 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbp1Q01514 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbp1Q01514 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbp1Q01514 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbp1Q01514 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbp1Q01514 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbp1Q01514 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gbp1Q01514 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gbp1Q01514 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gbp1Q01514 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gbp1Q01514 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gbp1Q01514 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gbp1Q01514 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gbp1Q01514 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gbp1Q01514 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gbp1Q01514 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gbp1Q01514 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gbp1Q01514 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gbp1Q01514 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gbp1Q01514 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gbp1Q01514 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gbp1Q01514 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gbp1Q01514 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gbp1Q01514 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gbp1Q01514 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gbp1Q01514 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gbp1Q01514 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gbp1Q01514 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gbp1Q01514 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gbp1Q01514 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gbp1Q01514 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gbp1Q01514 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gbp1Q01514 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gbp1Q01514 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Gbp1Q01514 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gbp1Q01514 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gbp1Q01514 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gbp1Q01514 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gbp1Q01514 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Gbp1Q01514 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Gbp1Q01514 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gbp1Q01514 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gbp1Q01514 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gbp1Q01514 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gbp1Q01514 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gbp1Q01514 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gbp1Q01514 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gbp1Q01514 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gbp1Q01514 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbp1Q01514 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbp1Q01514 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbp1Q01514 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbp1Q01514 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbp1Q01514 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbp1Q01514 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbp1Q01514 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbp1Q01514 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbp1Q01514 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbp1Q01514 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbp1Q01514 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbp1Q01514 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbp1Q01514 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbp1Q01514 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbp1Q01514 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbp1Q01514 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbp1Q01514 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbp1Q01514 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbp1Q01514 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbp1Q01514 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbp1Q01514 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbp1Q01514 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbp1Q01514 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbp1Q01514 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbp1Q01514 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbp1Q01514 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbp1Q01514 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbp1Q01514 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbp1Q01514 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbp1Q01514 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbp1Q01514 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbp1Q01514 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbp1Q01514 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbp1Q01514 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbp1Q01514 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbp1Q01514 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbp1Q01514 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbp1Q01514 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbp1Q01514 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbp1Q01514 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbp1Q01514 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbp1Q01514 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbp1Q01514 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbp1Q01514 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbp1Q01514 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbp1Q01514 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbp1Q01514 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms