Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EgfrQ01279 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EgfrQ01279 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EgfrQ01279 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EgfrQ01279 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EgfrQ01279 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EgfrQ01279 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EgfrQ01279 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EgfrQ01279 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EgfrQ01279 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EgfrQ01279 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EgfrQ01279 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EgfrQ01279 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EgfrQ01279 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EgfrQ01279 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EgfrQ01279 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EgfrQ01279 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EgfrQ01279 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
EgfrQ01279 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EgfrQ01279 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EgfrQ01279 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EgfrQ01279 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EgfrQ01279 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EgfrQ01279 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EgfrQ01279 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EgfrQ01279 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EgfrQ01279 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EgfrQ01279 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EgfrQ01279 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EgfrQ01279 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
EgfrQ01279 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
EgfrQ01279 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EgfrQ01279 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EgfrQ01279 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EgfrQ01279 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EgfrQ01279 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EgfrQ01279 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EgfrQ01279 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EgfrQ01279 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
EgfrQ01279 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EgfrQ01279 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EgfrQ01279 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EgfrQ01279 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EgfrQ01279 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EgfrQ01279 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EgfrQ01279 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EgfrQ01279 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EgfrQ01279 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EgfrQ01279 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EgfrQ01279 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EgfrQ01279 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EgfrQ01279 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EgfrQ01279 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EgfrQ01279 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
EgfrQ01279 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
EgfrQ01279 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EgfrQ01279 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
EgfrQ01279 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EgfrQ01279 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EgfrQ01279 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EgfrQ01279 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EgfrQ01279 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EgfrQ01279 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EgfrQ01279 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EgfrQ01279 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EgfrQ01279 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EgfrQ01279 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EgfrQ01279 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EgfrQ01279 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EgfrQ01279 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EgfrQ01279 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EgfrQ01279 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EgfrQ01279 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
EgfrQ01279 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
EgfrQ01279 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EgfrQ01279 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EgfrQ01279 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EgfrQ01279 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EgfrQ01279 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EgfrQ01279 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EgfrQ01279 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EgfrQ01279 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EgfrQ01279 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EgfrQ01279 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EgfrQ01279 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EgfrQ01279 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EgfrQ01279 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EgfrQ01279 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
EgfrQ01279 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EgfrQ01279 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EgfrQ01279 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
EgfrQ01279 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
EgfrQ01279 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EgfrQ01279 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EgfrQ01279 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
EgfrQ01279 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EgfrQ01279 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EgfrQ01279 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EgfrQ01279 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EgfrQ01279 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms