Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gja5Q01231 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gja5Q01231 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gja5Q01231 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gja5Q01231 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gja5Q01231 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gja5Q01231 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gja5Q01231 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gja5Q01231 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gja5Q01231 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gja5Q01231 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Gja5Q01231 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Gja5Q01231 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gja5Q01231 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Gja5Q01231 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Gja5Q01231 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gja5Q01231 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gja5Q01231 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gja5Q01231 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gja5Q01231 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gja5Q01231 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gja5Q01231 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gja5Q01231 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gja5Q01231 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gja5Q01231 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gja5Q01231 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Gja5Q01231 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gja5Q01231 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gja5Q01231 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Gja5Q01231 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gja5Q01231 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gja5Q01231 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gja5Q01231 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gja5Q01231 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gja5Q01231 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gja5Q01231 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gja5Q01231 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gja5Q01231 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gja5Q01231 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gja5Q01231 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gja5Q01231 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gja5Q01231 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gja5Q01231 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gja5Q01231 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gja5Q01231 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gja5Q01231 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gja5Q01231 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gja5Q01231 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gja5Q01231 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gja5Q01231 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gja5Q01231 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gja5Q01231 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gja5Q01231 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gja5Q01231 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gja5Q01231 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gja5Q01231 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gja5Q01231 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gja5Q01231 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Gja5Q01231 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gja5Q01231 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Gja5Q01231 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gja5Q01231 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gja5Q01231 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gja5Q01231 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gja5Q01231 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gja5Q01231 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gja5Q01231 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Gja5Q01231 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gja5Q01231 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gja5Q01231 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gja5Q01231 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gja5Q01231 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gja5Q01231 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gja5Q01231 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gja5Q01231 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gja5Q01231 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Gja5Q01231 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gja5Q01231 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gja5Q01231 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gja5Q01231 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gja5Q01231 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gja5Q01231 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Gja5Q01231 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gja5Q01231 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gja5Q01231 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gja5Q01231 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gja5Q01231 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gja5Q01231 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gja5Q01231 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gja5Q01231 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gja5Q01231 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gja5Q01231 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gja5Q01231 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gja5Q01231 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gja5Q01231 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gja5Q01231 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gja5Q01231 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gja5Q01231 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gja5Q01231 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Gja5Q01231 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms