Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Col1a2Q01149 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Col1a2Q01149 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Col1a2Q01149 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Col1a2Q01149 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Col1a2Q01149 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Col1a2Q01149 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Col1a2Q01149 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Col1a2Q01149 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Col1a2Q01149 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Col1a2Q01149 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Col1a2Q01149 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Col1a2Q01149 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Col1a2Q01149 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Col1a2Q01149 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Col1a2Q01149 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Col1a2Q01149 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Col1a2Q01149 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Col1a2Q01149 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Col1a2Q01149 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Col1a2Q01149 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Col1a2Q01149 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Col1a2Q01149 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Col1a2Q01149 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Col1a2Q01149 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Col1a2Q01149 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Col1a2Q01149 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Col1a2Q01149 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Col1a2Q01149 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Col1a2Q01149 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Col1a2Q01149 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Col1a2Q01149 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Col1a2Q01149 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Col1a2Q01149 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Col1a2Q01149 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Col1a2Q01149 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Col1a2Q01149 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Col1a2Q01149 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Col1a2Q01149 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Col1a2Q01149 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Col1a2Q01149 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Col1a2Q01149 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Col1a2Q01149 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Col1a2Q01149 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Col1a2Q01149 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Col1a2Q01149 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Col1a2Q01149 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Col1a2Q01149 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Col1a2Q01149 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Col1a2Q01149 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Col1a2Q01149 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Col1a2Q01149 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Col1a2Q01149 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Col1a2Q01149 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Col1a2Q01149 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Col1a2Q01149 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Col1a2Q01149 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Col1a2Q01149 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Col1a2Q01149 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Col1a2Q01149 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Col1a2Q01149 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Col1a2Q01149 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Col1a2Q01149 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Col1a2Q01149 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Col1a2Q01149 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Col1a2Q01149 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Col1a2Q01149 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Col1a2Q01149 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Col1a2Q01149 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Col1a2Q01149 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Col1a2Q01149 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Col1a2Q01149 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Col1a2Q01149 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Col1a2Q01149 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Col1a2Q01149 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Col1a2Q01149 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Col1a2Q01149 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Col1a2Q01149 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Col1a2Q01149 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Col1a2Q01149 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Col1a2Q01149 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Col1a2Q01149 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Col1a2Q01149 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Col1a2Q01149 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Col1a2Q01149 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Col1a2Q01149 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Col1a2Q01149 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Col1a2Q01149 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Col1a2Q01149 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Col1a2Q01149 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Col1a2Q01149 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Col1a2Q01149 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Col1a2Q01149 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Col1a2Q01149 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Col1a2Q01149 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Col1a2Q01149 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Col1a2Q01149 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Col1a2Q01149 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Col1a2Q01149 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Col1a2Q01149 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms