Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grin2cQ01098 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grin2cQ01098 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grin2cQ01098 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grin2cQ01098 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Grin2cQ01098 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Grin2cQ01098 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Grin2cQ01098 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Grin2cQ01098 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Grin2cQ01098 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Grin2cQ01098 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Grin2cQ01098 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Grin2cQ01098 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Grin2cQ01098 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Grin2cQ01098 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Grin2cQ01098 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Grin2cQ01098 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Grin2cQ01098 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Grin2cQ01098 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Grin2cQ01098 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Grin2cQ01098 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Grin2cQ01098 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Grin2cQ01098 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Grin2cQ01098 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Grin2cQ01098 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Grin2cQ01098 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Grin2cQ01098 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Grin2cQ01098 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Grin2cQ01098 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Grin2cQ01098 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Grin2cQ01098 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Grin2cQ01098 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Grin2cQ01098 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Grin2cQ01098 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Grin2cQ01098 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Grin2cQ01098 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Grin2cQ01098 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Grin2cQ01098 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Grin2cQ01098 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Grin2cQ01098 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Grin2cQ01098 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Grin2cQ01098 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Grin2cQ01098 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Grin2cQ01098 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Grin2cQ01098 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Grin2cQ01098 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Grin2cQ01098 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Grin2cQ01098 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Grin2cQ01098 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Grin2cQ01098 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Grin2cQ01098 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Grin2cQ01098 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Grin2cQ01098 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Grin2cQ01098 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Grin2cQ01098 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Grin2cQ01098 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Grin2cQ01098 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Grin2cQ01098 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Grin2cQ01098 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Grin2cQ01098 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Grin2cQ01098 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Grin2cQ01098 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Grin2cQ01098 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Grin2cQ01098 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Grin2cQ01098 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms