Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Grin2bQ01097 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Grin2bQ01097 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Grin2bQ01097 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Grin2bQ01097 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Grin2bQ01097 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Grin2bQ01097 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Grin2bQ01097 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Grin2bQ01097 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Grin2bQ01097 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Grin2bQ01097 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Grin2bQ01097 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Grin2bQ01097 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Grin2bQ01097 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Grin2bQ01097 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Grin2bQ01097 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Grin2bQ01097 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Grin2bQ01097 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Grin2bQ01097 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Grin2bQ01097 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Grin2bQ01097 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Grin2bQ01097 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Grin2bQ01097 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Grin2bQ01097 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Grin2bQ01097 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Grin2bQ01097 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Grin2bQ01097 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Grin2bQ01097 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Grin2bQ01097 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Grin2bQ01097 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Grin2bQ01097 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Grin2bQ01097 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Grin2bQ01097 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Grin2bQ01097 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Grin2bQ01097 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Grin2bQ01097 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Grin2bQ01097 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Grin2bQ01097 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Grin2bQ01097 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Grin2bQ01097 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Grin2bQ01097 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Grin2bQ01097 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Grin2bQ01097 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Grin2bQ01097 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Grin2bQ01097 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Grin2bQ01097 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Grin2bQ01097 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Grin2bQ01097 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Grin2bQ01097 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Grin2bQ01097 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Grin2bQ01097 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Grin2bQ01097 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Grin2bQ01097 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Grin2bQ01097 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Grin2bQ01097 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Grin2bQ01097 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Grin2bQ01097 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Grin2bQ01097 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Grin2bQ01097 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Grin2bQ01097 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Grin2bQ01097 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
Grin2bQ01097 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Grin2bQ01097 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
Grin2bQ01097 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Grin2bQ01097 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Grin2bQ01097 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Grin2bQ01097 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Grin2bQ01097 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Grin2bQ01097 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Grin2bQ01097 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Grin2bQ01097 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Grin2bQ01097 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Grin2bQ01097 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Grin2bQ01097 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Grin2bQ01097 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Grin2bQ01097 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Grin2bQ01097 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Grin2bQ01097 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Grin2bQ01097 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Grin2bQ01097 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Grin2bQ01097 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Grin2bQ01097 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Grin2bQ01097 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Grin2bQ01097 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Grin2bQ01097 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Grin2bQ01097 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Grin2bQ01097 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Grin2bQ01097 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Grin2bQ01097 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Grin2bQ01097 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Grin2bQ01097 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Grin2bQ01097 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Grin2bQ01097 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Grin2bQ01097 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Grin2bQ01097 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Grin2bQ01097 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Grin2bQ01097 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Grin2bQ01097 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Grin2bQ01097 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Grin2bQ01097 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms