Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms