Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Itga4Q00651 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms