Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gabpb1Q00420 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gabpb1Q00420 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gabpb1Q00420 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gabpb1Q00420 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gabpb1Q00420 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gabpb1Q00420 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gabpb1Q00420 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gabpb1Q00420 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gabpb1Q00420 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gabpb1Q00420 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gabpb1Q00420 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gabpb1Q00420 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gabpb1Q00420 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gabpb1Q00420 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gabpb1Q00420 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gabpb1Q00420 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gabpb1Q00420 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gabpb1Q00420 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gabpb1Q00420 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gabpb1Q00420 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gabpb1Q00420 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gabpb1Q00420 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gabpb1Q00420 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gabpb1Q00420 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gabpb1Q00420 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gabpb1Q00420 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gabpb1Q00420 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gabpb1Q00420 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gabpb1Q00420 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gabpb1Q00420 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gabpb1Q00420 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gabpb1Q00420 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gabpb1Q00420 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gabpb1Q00420 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gabpb1Q00420 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gabpb1Q00420 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gabpb1Q00420 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gabpb1Q00420 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms