Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms