Protein–RNA interactions for Protein: P98191

Cds1, Phosphatidate cytidylyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cds1P98191 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cds1P98191 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cds1P98191 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cds1P98191 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cds1P98191 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cds1P98191 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cds1P98191 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cds1P98191 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cds1P98191 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms