Protein–RNA interactions for Protein: P97762

rp9, Retinitis pigmentosa 9 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
rp9P97762 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
rp9P97762 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
rp9P97762 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
rp9P97762 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
rp9P97762 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
rp9P97762 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
rp9P97762 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
rp9P97762 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
rp9P97762 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
rp9P97762 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
rp9P97762 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
rp9P97762 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
rp9P97762 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
rp9P97762 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
rp9P97762 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
rp9P97762 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
rp9P97762 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
rp9P97762 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
rp9P97762 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
rp9P97762 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
rp9P97762 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
rp9P97762 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
rp9P97762 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
rp9P97762 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
rp9P97762 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
rp9P97762 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
rp9P97762 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
rp9P97762 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
rp9P97762 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
rp9P97762 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
rp9P97762 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
rp9P97762 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
rp9P97762 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
rp9P97762 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
rp9P97762 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
rp9P97762 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
rp9P97762 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
rp9P97762 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
rp9P97762 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
rp9P97762 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
rp9P97762 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
rp9P97762 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
rp9P97762 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
rp9P97762 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
rp9P97762 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
rp9P97762 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
rp9P97762 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
rp9P97762 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
rp9P97762 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
rp9P97762 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
rp9P97762 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
rp9P97762 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
rp9P97762 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
rp9P97762 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
rp9P97762 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
rp9P97762 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
rp9P97762 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
rp9P97762 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
rp9P97762 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
rp9P97762 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
rp9P97762 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
rp9P97762 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
rp9P97762 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
rp9P97762 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
rp9P97762 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
rp9P97762 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
rp9P97762 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
rp9P97762 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
rp9P97762 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
rp9P97762 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
rp9P97762 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
rp9P97762 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
rp9P97762 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
rp9P97762 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
rp9P97762 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
rp9P97762 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
rp9P97762 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
rp9P97762 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
rp9P97762 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
rp9P97762 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
rp9P97762 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
rp9P97762 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
rp9P97762 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
rp9P97762 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
rp9P97762 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
rp9P97762 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
rp9P97762 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
rp9P97762 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
rp9P97762 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
rp9P97762 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
rp9P97762 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
rp9P97762 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
rp9P97762 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
rp9P97762 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
rp9P97762 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
rp9P97762 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
rp9P97762 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
rp9P97762 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
rp9P97762 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
rp9P97762 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms