Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Smarcc1P97496 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Smarcc1P97496 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Smarcc1P97496 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Smarcc1P97496 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Smarcc1P97496 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Smarcc1P97496 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Smarcc1P97496 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Smarcc1P97496 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Smarcc1P97496 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Smarcc1P97496 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smarcc1P97496 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smarcc1P97496 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smarcc1P97496 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smarcc1P97496 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smarcc1P97496 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smarcc1P97496 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smarcc1P97496 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smarcc1P97496 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smarcc1P97496 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smarcc1P97496 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smarcc1P97496 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smarcc1P97496 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smarcc1P97496 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smarcc1P97496 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smarcc1P97496 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smarcc1P97496 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smarcc1P97496 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smarcc1P97496 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smarcc1P97496 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smarcc1P97496 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smarcc1P97496 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smarcc1P97496 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smarcc1P97496 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smarcc1P97496 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smarcc1P97496 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smarcc1P97496 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smarcc1P97496 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smarcc1P97496 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smarcc1P97496 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smarcc1P97496 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smarcc1P97496 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smarcc1P97496 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smarcc1P97496 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smarcc1P97496 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smarcc1P97496 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smarcc1P97496 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smarcc1P97496 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smarcc1P97496 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smarcc1P97496 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smarcc1P97496 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smarcc1P97496 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smarcc1P97496 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smarcc1P97496 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smarcc1P97496 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Smarcc1P97496 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smarcc1P97496 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smarcc1P97496 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smarcc1P97496 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smarcc1P97496 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smarcc1P97496 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smarcc1P97496 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smarcc1P97496 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smarcc1P97496 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smarcc1P97496 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smarcc1P97496 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smarcc1P97496 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smarcc1P97496 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Smarcc1P97496 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smarcc1P97496 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smarcc1P97496 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Smarcc1P97496 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Smarcc1P97496 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smarcc1P97496 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smarcc1P97496 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smarcc1P97496 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smarcc1P97496 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smarcc1P97496 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Smarcc1P97496 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Smarcc1P97496 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Smarcc1P97496 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smarcc1P97496 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smarcc1P97496 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smarcc1P97496 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smarcc1P97496 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Smarcc1P97496 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smarcc1P97496 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smarcc1P97496 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smarcc1P97496 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smarcc1P97496 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smarcc1P97496 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smarcc1P97496 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smarcc1P97496 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smarcc1P97496 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smarcc1P97496 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smarcc1P97496 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smarcc1P97496 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smarcc1P97496 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smarcc1P97496 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smarcc1P97496 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms