Protein–RNA interactions for Protein: P97468

Cmklr1, Chemokine-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmklr1P97468 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cmklr1P97468 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cmklr1P97468 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cmklr1P97468 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cmklr1P97468 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cmklr1P97468 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cmklr1P97468 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cmklr1P97468 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cmklr1P97468 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cmklr1P97468 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cmklr1P97468 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cmklr1P97468 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cmklr1P97468 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cmklr1P97468 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cmklr1P97468 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cmklr1P97468 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cmklr1P97468 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cmklr1P97468 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cmklr1P97468 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cmklr1P97468 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cmklr1P97468 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cmklr1P97468 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cmklr1P97468 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cmklr1P97468 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cmklr1P97468 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cmklr1P97468 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cmklr1P97468 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cmklr1P97468 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cmklr1P97468 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cmklr1P97468 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cmklr1P97468 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cmklr1P97468 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cmklr1P97468 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cmklr1P97468 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cmklr1P97468 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cmklr1P97468 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cmklr1P97468 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cmklr1P97468 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cmklr1P97468 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cmklr1P97468 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cmklr1P97468 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cmklr1P97468 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cmklr1P97468 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cmklr1P97468 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cmklr1P97468 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cmklr1P97468 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cmklr1P97468 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cmklr1P97468 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cmklr1P97468 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cmklr1P97468 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cmklr1P97468 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cmklr1P97468 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cmklr1P97468 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cmklr1P97468 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cmklr1P97468 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cmklr1P97468 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cmklr1P97468 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cmklr1P97468 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cmklr1P97468 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cmklr1P97468 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cmklr1P97468 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cmklr1P97468 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cmklr1P97468 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cmklr1P97468 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cmklr1P97468 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cmklr1P97468 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cmklr1P97468 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cmklr1P97468 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cmklr1P97468 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms