Protein–RNA interactions for Protein: P97386

Lig3, DNA ligase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig3P97386 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lig3P97386 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lig3P97386 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lig3P97386 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lig3P97386 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lig3P97386 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lig3P97386 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lig3P97386 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lig3P97386 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lig3P97386 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lig3P97386 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lig3P97386 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lig3P97386 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lig3P97386 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lig3P97386 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lig3P97386 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lig3P97386 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lig3P97386 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lig3P97386 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lig3P97386 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lig3P97386 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lig3P97386 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lig3P97386 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lig3P97386 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lig3P97386 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lig3P97386 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lig3P97386 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lig3P97386 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lig3P97386 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lig3P97386 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lig3P97386 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lig3P97386 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lig3P97386 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lig3P97386 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lig3P97386 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lig3P97386 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lig3P97386 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lig3P97386 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lig3P97386 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lig3P97386 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lig3P97386 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lig3P97386 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Lig3P97386 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lig3P97386 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lig3P97386 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lig3P97386 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lig3P97386 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lig3P97386 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lig3P97386 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lig3P97386 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lig3P97386 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lig3P97386 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lig3P97386 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lig3P97386 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lig3P97386 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Lig3P97386 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Lig3P97386 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lig3P97386 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lig3P97386 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lig3P97386 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lig3P97386 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lig3P97386 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lig3P97386 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lig3P97386 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Lig3P97386 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lig3P97386 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lig3P97386 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lig3P97386 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lig3P97386 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lig3P97386 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lig3P97386 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Lig3P97386 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lig3P97386 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lig3P97386 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lig3P97386 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lig3P97386 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lig3P97386 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lig3P97386 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lig3P97386 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lig3P97386 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lig3P97386 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lig3P97386 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lig3P97386 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Lig3P97386 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lig3P97386 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lig3P97386 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lig3P97386 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lig3P97386 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lig3P97386 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lig3P97386 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lig3P97386 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lig3P97386 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lig3P97386 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lig3P97386 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Lig3P97386 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lig3P97386 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Lig3P97386 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lig3P97386 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lig3P97386 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lig3P97386 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms