Protein–RNA interactions for Protein: P97298

Serpinf1, Pigment epithelium-derived factor, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpinf1P97298 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Serpinf1P97298 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Serpinf1P97298 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Serpinf1P97298 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Serpinf1P97298 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Serpinf1P97298 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Serpinf1P97298 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Serpinf1P97298 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Serpinf1P97298 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Serpinf1P97298 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Serpinf1P97298 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Serpinf1P97298 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Serpinf1P97298 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Serpinf1P97298 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Serpinf1P97298 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Serpinf1P97298 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Serpinf1P97298 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Serpinf1P97298 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Serpinf1P97298 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Serpinf1P97298 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Serpinf1P97298 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Serpinf1P97298 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Serpinf1P97298 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Serpinf1P97298 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Serpinf1P97298 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Serpinf1P97298 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Serpinf1P97298 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Serpinf1P97298 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Serpinf1P97298 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Serpinf1P97298 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Serpinf1P97298 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Serpinf1P97298 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Serpinf1P97298 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Serpinf1P97298 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Serpinf1P97298 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Serpinf1P97298 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Serpinf1P97298 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Serpinf1P97298 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Serpinf1P97298 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Serpinf1P97298 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Serpinf1P97298 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Serpinf1P97298 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Serpinf1P97298 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Serpinf1P97298 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Serpinf1P97298 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Serpinf1P97298 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Serpinf1P97298 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Serpinf1P97298 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Serpinf1P97298 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Serpinf1P97298 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Serpinf1P97298 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Serpinf1P97298 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Serpinf1P97298 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Serpinf1P97298 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Serpinf1P97298 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Serpinf1P97298 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Serpinf1P97298 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Serpinf1P97298 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Serpinf1P97298 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Serpinf1P97298 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Serpinf1P97298 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Serpinf1P97298 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Serpinf1P97298 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Serpinf1P97298 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Serpinf1P97298 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Serpinf1P97298 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Serpinf1P97298 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Serpinf1P97298 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Serpinf1P97298 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Serpinf1P97298 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Serpinf1P97298 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Serpinf1P97298 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Serpinf1P97298 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Serpinf1P97298 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Serpinf1P97298 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Serpinf1P97298 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Serpinf1P97298 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Serpinf1P97298 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Serpinf1P97298 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Serpinf1P97298 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Serpinf1P97298 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Serpinf1P97298 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Serpinf1P97298 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Serpinf1P97298 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Serpinf1P97298 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Serpinf1P97298 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Serpinf1P97298 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Serpinf1P97298 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Serpinf1P97298 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Serpinf1P97298 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Serpinf1P97298 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Serpinf1P97298 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Serpinf1P97298 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Serpinf1P97298 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Serpinf1P97298 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Serpinf1P97298 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Serpinf1P97298 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Serpinf1P97298 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Serpinf1P97298 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Serpinf1P97298 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms