Protein–RNA interactions for Protein: P81269

Atf1, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf1P81269 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atf1P81269 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atf1P81269 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atf1P81269 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atf1P81269 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atf1P81269 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atf1P81269 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atf1P81269 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms