Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx2P81066 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx2P81066 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Irx2P81066 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Irx2P81066 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Irx2P81066 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Irx2P81066 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms