Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Otx2P80206 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Otx2P80206 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Otx2P80206 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Otx2P80206 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Otx2P80206 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Otx2P80206 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Otx2P80206 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Otx2P80206 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Otx2P80206 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Otx2P80206 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Otx2P80206 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Otx2P80206 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Otx2P80206 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Otx2P80206 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Otx2P80206 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Otx2P80206 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Otx2P80206 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Otx2P80206 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Otx2P80206 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Otx2P80206 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Otx2P80206 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Otx2P80206 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Otx2P80206 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Otx2P80206 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Otx2P80206 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Otx2P80206 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Otx2P80206 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Otx2P80206 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Otx2P80206 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Otx2P80206 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Otx2P80206 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Otx2P80206 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Otx2P80206 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Otx2P80206 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Otx2P80206 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Otx2P80206 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Otx2P80206 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Otx2P80206 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Otx2P80206 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Otx2P80206 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Otx2P80206 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Otx2P80206 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Otx2P80206 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Otx2P80206 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Otx2P80206 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Otx2P80206 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Otx2P80206 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Otx2P80206 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Otx2P80206 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Otx2P80206 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Otx2P80206 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Otx2P80206 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otx2P80206 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otx2P80206 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otx2P80206 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otx2P80206 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otx2P80206 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otx2P80206 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otx2P80206 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otx2P80206 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otx2P80206 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otx2P80206 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otx2P80206 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otx2P80206 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otx2P80206 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Otx2P80206 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otx2P80206 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Otx2P80206 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otx2P80206 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otx2P80206 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otx2P80206 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otx2P80206 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otx2P80206 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otx2P80206 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otx2P80206 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otx2P80206 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otx2P80206 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otx2P80206 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otx2P80206 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otx2P80206 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otx2P80206 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otx2P80206 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otx2P80206 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otx2P80206 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otx2P80206 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otx2P80206 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otx2P80206 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otx2P80206 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otx2P80206 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otx2P80206 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otx2P80206 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otx2P80206 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otx2P80206 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otx2P80206 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otx2P80206 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otx2P80206 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otx2P80206 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Otx2P80206 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otx2P80206 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms