Protein–RNA interactions for Protein: P70362

Ufd1, Ubiquitin recognition factor in ER-associated degradation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufd1P70362 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Ufd1P70362 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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