Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Msx3P70354 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Msx3P70354 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Msx3P70354 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Msx3P70354 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Msx3P70354 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Msx3P70354 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Msx3P70354 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Msx3P70354 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Msx3P70354 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Msx3P70354 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Msx3P70354 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Msx3P70354 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Msx3P70354 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Msx3P70354 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Msx3P70354 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Msx3P70354 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Msx3P70354 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Msx3P70354 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Msx3P70354 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Msx3P70354 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msx3P70354 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msx3P70354 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msx3P70354 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msx3P70354 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msx3P70354 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msx3P70354 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msx3P70354 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msx3P70354 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msx3P70354 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msx3P70354 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Msx3P70354 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msx3P70354 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msx3P70354 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msx3P70354 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msx3P70354 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Msx3P70354 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msx3P70354 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msx3P70354 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msx3P70354 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msx3P70354 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msx3P70354 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msx3P70354 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msx3P70354 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msx3P70354 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msx3P70354 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msx3P70354 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msx3P70354 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msx3P70354 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msx3P70354 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msx3P70354 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msx3P70354 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msx3P70354 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msx3P70354 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msx3P70354 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msx3P70354 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Msx3P70354 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Msx3P70354 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msx3P70354 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msx3P70354 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msx3P70354 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msx3P70354 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msx3P70354 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msx3P70354 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msx3P70354 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msx3P70354 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msx3P70354 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msx3P70354 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msx3P70354 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msx3P70354 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Msx3P70354 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Msx3P70354 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Msx3P70354 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Msx3P70354 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Msx3P70354 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Msx3P70354 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Msx3P70354 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Msx3P70354 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Msx3P70354 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Msx3P70354 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Msx3P70354 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Msx3P70354 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Msx3P70354 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Msx3P70354 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Msx3P70354 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Msx3P70354 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Msx3P70354 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Msx3P70354 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Msx3P70354 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Msx3P70354 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Msx3P70354 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Msx3P70354 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Msx3P70354 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Msx3P70354 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Msx3P70354 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Msx3P70354 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Msx3P70354 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Msx3P70354 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Msx3P70354 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Msx3P70354 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms