Protein–RNA interactions for Protein: P70327

Tbx6, T-box transcription factor TBX6, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbx6P70327 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tbx6P70327 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tbx6P70327 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tbx6P70327 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tbx6P70327 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tbx6P70327 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tbx6P70327 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tbx6P70327 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tbx6P70327 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tbx6P70327 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tbx6P70327 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tbx6P70327 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tbx6P70327 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tbx6P70327 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tbx6P70327 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tbx6P70327 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tbx6P70327 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tbx6P70327 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tbx6P70327 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tbx6P70327 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tbx6P70327 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tbx6P70327 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tbx6P70327 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tbx6P70327 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tbx6P70327 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tbx6P70327 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tbx6P70327 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tbx6P70327 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tbx6P70327 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tbx6P70327 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tbx6P70327 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tbx6P70327 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tbx6P70327 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tbx6P70327 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tbx6P70327 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tbx6P70327 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tbx6P70327 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tbx6P70327 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tbx6P70327 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tbx6P70327 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tbx6P70327 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tbx6P70327 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tbx6P70327 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tbx6P70327 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tbx6P70327 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tbx6P70327 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tbx6P70327 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tbx6P70327 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tbx6P70327 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tbx6P70327 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tbx6P70327 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tbx6P70327 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tbx6P70327 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tbx6P70327 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tbx6P70327 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms