Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Cux2P70298 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Cux2P70298 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cux2P70298 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Cux2P70298 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cux2P70298 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cux2P70298 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cux2P70298 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cux2P70298 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cux2P70298 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cux2P70298 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Cux2P70298 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cux2P70298 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cux2P70298 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cux2P70298 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cux2P70298 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cux2P70298 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cux2P70298 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cux2P70298 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cux2P70298 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cux2P70298 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cux2P70298 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cux2P70298 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cux2P70298 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cux2P70298 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cux2P70298 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cux2P70298 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cux2P70298 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cux2P70298 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cux2P70298 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Cux2P70298 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cux2P70298 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cux2P70298 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cux2P70298 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cux2P70298 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cux2P70298 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cux2P70298 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cux2P70298 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cux2P70298 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cux2P70298 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cux2P70298 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cux2P70298 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cux2P70298 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cux2P70298 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Cux2P70298 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cux2P70298 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cux2P70298 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cux2P70298 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cux2P70298 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cux2P70298 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cux2P70298 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cux2P70298 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cux2P70298 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cux2P70298 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cux2P70298 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cux2P70298 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Cux2P70298 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Cux2P70298 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Cux2P70298 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cux2P70298 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cux2P70298 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cux2P70298 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cux2P70298 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cux2P70298 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cux2P70298 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cux2P70298 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Cux2P70298 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cux2P70298 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cux2P70298 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cux2P70298 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cux2P70298 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cux2P70298 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cux2P70298 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cux2P70298 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cux2P70298 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cux2P70298 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cux2P70298 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cux2P70298 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cux2P70298 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cux2P70298 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cux2P70298 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cux2P70298 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cux2P70298 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cux2P70298 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cux2P70298 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cux2P70298 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cux2P70298 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cux2P70298 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cux2P70298 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Cux2P70298 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cux2P70298 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cux2P70298 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cux2P70298 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cux2P70298 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Cux2P70298 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cux2P70298 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cux2P70298 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cux2P70298 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cux2P70298 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cux2P70298 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms