Protein–RNA interactions for Protein: P70211

Dcc, Netrin receptor DCC, mousemouse

Predictions only

Length 1,447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DccP70211 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DccP70211 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DccP70211 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DccP70211 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DccP70211 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DccP70211 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DccP70211 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DccP70211 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DccP70211 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DccP70211 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DccP70211 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DccP70211 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DccP70211 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DccP70211 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DccP70211 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DccP70211 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DccP70211 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DccP70211 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DccP70211 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DccP70211 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
DccP70211 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DccP70211 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DccP70211 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DccP70211 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
DccP70211 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DccP70211 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DccP70211 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DccP70211 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DccP70211 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DccP70211 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DccP70211 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DccP70211 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DccP70211 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DccP70211 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DccP70211 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DccP70211 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DccP70211 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
DccP70211 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DccP70211 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
DccP70211 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DccP70211 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DccP70211 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DccP70211 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DccP70211 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DccP70211 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DccP70211 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DccP70211 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DccP70211 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DccP70211 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DccP70211 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DccP70211 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DccP70211 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DccP70211 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DccP70211 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DccP70211 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DccP70211 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DccP70211 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DccP70211 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DccP70211 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DccP70211 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DccP70211 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DccP70211 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DccP70211 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DccP70211 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
DccP70211 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DccP70211 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DccP70211 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DccP70211 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DccP70211 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DccP70211 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
DccP70211 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DccP70211 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DccP70211 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DccP70211 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DccP70211 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DccP70211 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DccP70211 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DccP70211 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DccP70211 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DccP70211 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DccP70211 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DccP70211 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DccP70211 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DccP70211 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DccP70211 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DccP70211 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DccP70211 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DccP70211 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DccP70211 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DccP70211 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DccP70211 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DccP70211 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DccP70211 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DccP70211 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DccP70211 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DccP70211 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DccP70211 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DccP70211 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DccP70211 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DccP70211 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms