Protein–RNA interactions for Protein: P63072

Ubd, Ubiquitin D, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbdP63072 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UbdP63072 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
UbdP63072 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
UbdP63072 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UbdP63072 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
UbdP63072 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UbdP63072 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
UbdP63072 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UbdP63072 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UbdP63072 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UbdP63072 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UbdP63072 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UbdP63072 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
UbdP63072 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
UbdP63072 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UbdP63072 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UbdP63072 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UbdP63072 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UbdP63072 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
UbdP63072 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UbdP63072 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UbdP63072 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UbdP63072 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UbdP63072 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UbdP63072 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
UbdP63072 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UbdP63072 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
UbdP63072 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UbdP63072 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UbdP63072 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UbdP63072 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UbdP63072 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UbdP63072 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UbdP63072 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UbdP63072 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UbdP63072 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UbdP63072 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UbdP63072 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UbdP63072 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
UbdP63072 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UbdP63072 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UbdP63072 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UbdP63072 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UbdP63072 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
UbdP63072 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UbdP63072 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UbdP63072 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UbdP63072 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UbdP63072 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UbdP63072 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UbdP63072 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UbdP63072 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UbdP63072 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UbdP63072 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UbdP63072 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UbdP63072 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UbdP63072 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UbdP63072 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UbdP63072 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
UbdP63072 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UbdP63072 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UbdP63072 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UbdP63072 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UbdP63072 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UbdP63072 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UbdP63072 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UbdP63072 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
UbdP63072 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UbdP63072 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UbdP63072 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UbdP63072 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UbdP63072 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UbdP63072 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UbdP63072 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UbdP63072 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UbdP63072 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UbdP63072 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UbdP63072 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UbdP63072 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UbdP63072 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UbdP63072 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UbdP63072 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UbdP63072 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UbdP63072 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
UbdP63072 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
UbdP63072 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UbdP63072 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UbdP63072 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UbdP63072 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
UbdP63072 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UbdP63072 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UbdP63072 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UbdP63072 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UbdP63072 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UbdP63072 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UbdP63072 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UbdP63072 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UbdP63072 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UbdP63072 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UbdP63072 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms