Protein–RNA interactions for Protein: P62821

Rab1A, Ras-related protein Rab-1A, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab1AP62821 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Rab1AP62821 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab1AP62821 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab1AP62821 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Rab1AP62821 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab1AP62821 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab1AP62821 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab1AP62821 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab1AP62821 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab1AP62821 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab1AP62821 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab1AP62821 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab1AP62821 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab1AP62821 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab1AP62821 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab1AP62821 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Rab1AP62821 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab1AP62821 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab1AP62821 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab1AP62821 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab1AP62821 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab1AP62821 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab1AP62821 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab1AP62821 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab1AP62821 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Rab1AP62821 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab1AP62821 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab1AP62821 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab1AP62821 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab1AP62821 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab1AP62821 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab1AP62821 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Rab1AP62821 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab1AP62821 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Rab1AP62821 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Rab1AP62821 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Rab1AP62821 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab1AP62821 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab1AP62821 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab1AP62821 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab1AP62821 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab1AP62821 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab1AP62821 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab1AP62821 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab1AP62821 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Rab1AP62821 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab1AP62821 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab1AP62821 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Rab1AP62821 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Rab1AP62821 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab1AP62821 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab1AP62821 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab1AP62821 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab1AP62821 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab1AP62821 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab1AP62821 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab1AP62821 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab1AP62821 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab1AP62821 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab1AP62821 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab1AP62821 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab1AP62821 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab1AP62821 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab1AP62821 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab1AP62821 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rab1AP62821 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rab1AP62821 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rab1AP62821 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rab1AP62821 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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