Protein–RNA interactions for Protein: P62702

Rps4x, 40S ribosomal protein S4, X isoform, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps4xP62702 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps4xP62702 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps4xP62702 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps4xP62702 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps4xP62702 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps4xP62702 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps4xP62702 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps4xP62702 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps4xP62702 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps4xP62702 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps4xP62702 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps4xP62702 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps4xP62702 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps4xP62702 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps4xP62702 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps4xP62702 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps4xP62702 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps4xP62702 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps4xP62702 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps4xP62702 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps4xP62702 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps4xP62702 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps4xP62702 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps4xP62702 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps4xP62702 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps4xP62702 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps4xP62702 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps4xP62702 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps4xP62702 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps4xP62702 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps4xP62702 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps4xP62702 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps4xP62702 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps4xP62702 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps4xP62702 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps4xP62702 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps4xP62702 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps4xP62702 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps4xP62702 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps4xP62702 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps4xP62702 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms