Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms