Protein–RNA interactions for Protein: P61290

Psme3, Proteasome activator complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme3P61290 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psme3P61290 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psme3P61290 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.8 ms