Protein–RNA interactions for Protein: P61164

Actr1a, Alpha-centractin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actr1aP61164 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Actr1aP61164 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Actr1aP61164 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Actr1aP61164 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Actr1aP61164 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Actr1aP61164 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Actr1aP61164 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Actr1aP61164 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Actr1aP61164 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Actr1aP61164 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Actr1aP61164 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Actr1aP61164 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Actr1aP61164 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Actr1aP61164 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Actr1aP61164 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Actr1aP61164 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Actr1aP61164 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Actr1aP61164 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Actr1aP61164 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Actr1aP61164 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Actr1aP61164 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Actr1aP61164 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Actr1aP61164 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Actr1aP61164 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Actr1aP61164 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Actr1aP61164 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Actr1aP61164 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Actr1aP61164 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Actr1aP61164 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Actr1aP61164 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Actr1aP61164 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Actr1aP61164 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Actr1aP61164 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Actr1aP61164 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Actr1aP61164 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Actr1aP61164 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Actr1aP61164 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Actr1aP61164 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Actr1aP61164 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Actr1aP61164 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Actr1aP61164 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Actr1aP61164 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Actr1aP61164 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Actr1aP61164 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Actr1aP61164 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Actr1aP61164 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Actr1aP61164 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Actr1aP61164 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Actr1aP61164 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Actr1aP61164 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Actr1aP61164 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Actr1aP61164 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Actr1aP61164 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Actr1aP61164 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Actr1aP61164 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Actr1aP61164 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Actr1aP61164 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Actr1aP61164 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Actr1aP61164 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Actr1aP61164 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Actr1aP61164 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms