Protein–RNA interactions for Protein: P60710

Actb, Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ActbP60710 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ActbP60710 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ActbP60710 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ActbP60710 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ActbP60710 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ActbP60710 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ActbP60710 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ActbP60710 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ActbP60710 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ActbP60710 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ActbP60710 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ActbP60710 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ActbP60710 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ActbP60710 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ActbP60710 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ActbP60710 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ActbP60710 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ActbP60710 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ActbP60710 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ActbP60710 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ActbP60710 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ActbP60710 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ActbP60710 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ActbP60710 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ActbP60710 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ActbP60710 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ActbP60710 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ActbP60710 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ActbP60710 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ActbP60710 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ActbP60710 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ActbP60710 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ActbP60710 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ActbP60710 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ActbP60710 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ActbP60710 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ActbP60710 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ActbP60710 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ActbP60710 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ActbP60710 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ActbP60710 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ActbP60710 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ActbP60710 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ActbP60710 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ActbP60710 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ActbP60710 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ActbP60710 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ActbP60710 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ActbP60710 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ActbP60710 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ActbP60710 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ActbP60710 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ActbP60710 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ActbP60710 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ActbP60710 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ActbP60710 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ActbP60710 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ActbP60710 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ActbP60710 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ActbP60710 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ActbP60710 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ActbP60710 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ActbP60710 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ActbP60710 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ActbP60710 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ActbP60710 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ActbP60710 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ActbP60710 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ActbP60710 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ActbP60710 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ActbP60710 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ActbP60710 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ActbP60710 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ActbP60710 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ActbP60710 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ActbP60710 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ActbP60710 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ActbP60710 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ActbP60710 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ActbP60710 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ActbP60710 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ActbP60710 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ActbP60710 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ActbP60710 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ActbP60710 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ActbP60710 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ActbP60710 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ActbP60710 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ActbP60710 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ActbP60710 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ActbP60710 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ActbP60710 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ActbP60710 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ActbP60710 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ActbP60710 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ActbP60710 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ActbP60710 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ActbP60710 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ActbP60710 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ActbP60710 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms