Protein–RNA interactions for Protein: P59222

Scarf2, Scavenger receptor class F member 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf2P59222 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scarf2P59222 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scarf2P59222 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Scarf2P59222 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scarf2P59222 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scarf2P59222 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scarf2P59222 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scarf2P59222 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scarf2P59222 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scarf2P59222 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scarf2P59222 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scarf2P59222 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scarf2P59222 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scarf2P59222 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scarf2P59222 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scarf2P59222 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scarf2P59222 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scarf2P59222 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scarf2P59222 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scarf2P59222 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scarf2P59222 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scarf2P59222 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scarf2P59222 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scarf2P59222 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scarf2P59222 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scarf2P59222 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scarf2P59222 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scarf2P59222 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scarf2P59222 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scarf2P59222 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scarf2P59222 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scarf2P59222 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Scarf2P59222 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scarf2P59222 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scarf2P59222 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scarf2P59222 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scarf2P59222 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Scarf2P59222 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scarf2P59222 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scarf2P59222 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scarf2P59222 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scarf2P59222 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scarf2P59222 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Scarf2P59222 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scarf2P59222 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scarf2P59222 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scarf2P59222 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Scarf2P59222 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms