Protein–RNA interactions for Protein: P59048

Pdrg1, p53 and DNA damage-regulated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdrg1P59048 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdrg1P59048 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdrg1P59048 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdrg1P59048 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdrg1P59048 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdrg1P59048 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdrg1P59048 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdrg1P59048 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdrg1P59048 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdrg1P59048 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdrg1P59048 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdrg1P59048 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdrg1P59048 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdrg1P59048 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdrg1P59048 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdrg1P59048 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdrg1P59048 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdrg1P59048 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdrg1P59048 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdrg1P59048 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdrg1P59048 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdrg1P59048 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdrg1P59048 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdrg1P59048 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdrg1P59048 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdrg1P59048 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdrg1P59048 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdrg1P59048 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdrg1P59048 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdrg1P59048 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdrg1P59048 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdrg1P59048 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdrg1P59048 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdrg1P59048 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdrg1P59048 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdrg1P59048 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdrg1P59048 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdrg1P59048 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdrg1P59048 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdrg1P59048 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdrg1P59048 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdrg1P59048 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdrg1P59048 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdrg1P59048 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdrg1P59048 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pdrg1P59048 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pdrg1P59048 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pdrg1P59048 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pdrg1P59048 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdrg1P59048 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdrg1P59048 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdrg1P59048 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdrg1P59048 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdrg1P59048 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdrg1P59048 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdrg1P59048 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdrg1P59048 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdrg1P59048 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdrg1P59048 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdrg1P59048 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdrg1P59048 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdrg1P59048 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdrg1P59048 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdrg1P59048 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdrg1P59048 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdrg1P59048 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdrg1P59048 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdrg1P59048 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdrg1P59048 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdrg1P59048 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdrg1P59048 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdrg1P59048 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdrg1P59048 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdrg1P59048 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdrg1P59048 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdrg1P59048 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdrg1P59048 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdrg1P59048 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdrg1P59048 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdrg1P59048 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdrg1P59048 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdrg1P59048 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdrg1P59048 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdrg1P59048 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdrg1P59048 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdrg1P59048 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdrg1P59048 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdrg1P59048 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdrg1P59048 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdrg1P59048 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdrg1P59048 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdrg1P59048 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdrg1P59048 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdrg1P59048 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdrg1P59048 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdrg1P59048 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdrg1P59048 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdrg1P59048 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdrg1P59048 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdrg1P59048 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms