Protein–RNA interactions for Protein: P58406

Hrh3, Histamine H3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hrh3P58406 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hrh3P58406 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hrh3P58406 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hrh3P58406 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hrh3P58406 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hrh3P58406 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hrh3P58406 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hrh3P58406 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hrh3P58406 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hrh3P58406 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hrh3P58406 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hrh3P58406 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hrh3P58406 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hrh3P58406 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hrh3P58406 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hrh3P58406 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hrh3P58406 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hrh3P58406 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hrh3P58406 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hrh3P58406 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hrh3P58406 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hrh3P58406 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hrh3P58406 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hrh3P58406 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hrh3P58406 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hrh3P58406 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hrh3P58406 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hrh3P58406 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hrh3P58406 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hrh3P58406 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hrh3P58406 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hrh3P58406 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hrh3P58406 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hrh3P58406 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hrh3P58406 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hrh3P58406 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hrh3P58406 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hrh3P58406 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hrh3P58406 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hrh3P58406 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hrh3P58406 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hrh3P58406 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hrh3P58406 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hrh3P58406 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hrh3P58406 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hrh3P58406 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hrh3P58406 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hrh3P58406 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hrh3P58406 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hrh3P58406 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hrh3P58406 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hrh3P58406 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hrh3P58406 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hrh3P58406 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hrh3P58406 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hrh3P58406 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hrh3P58406 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hrh3P58406 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hrh3P58406 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hrh3P58406 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hrh3P58406 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hrh3P58406 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hrh3P58406 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hrh3P58406 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hrh3P58406 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hrh3P58406 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hrh3P58406 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hrh3P58406 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hrh3P58406 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hrh3P58406 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hrh3P58406 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hrh3P58406 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hrh3P58406 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hrh3P58406 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hrh3P58406 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hrh3P58406 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms