Protein–RNA interactions for Protein: P58334

Klf16, Krueppel-like factor 16, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf16P58334 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf16P58334 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf16P58334 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf16P58334 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf16P58334 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf16P58334 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf16P58334 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf16P58334 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf16P58334 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf16P58334 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf16P58334 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf16P58334 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf16P58334 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf16P58334 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf16P58334 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf16P58334 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf16P58334 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf16P58334 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf16P58334 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf16P58334 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf16P58334 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf16P58334 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf16P58334 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf16P58334 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf16P58334 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf16P58334 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf16P58334 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf16P58334 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf16P58334 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf16P58334 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf16P58334 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf16P58334 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf16P58334 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf16P58334 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf16P58334 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf16P58334 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf16P58334 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf16P58334 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf16P58334 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf16P58334 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf16P58334 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf16P58334 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf16P58334 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf16P58334 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf16P58334 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf16P58334 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf16P58334 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf16P58334 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf16P58334 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf16P58334 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf16P58334 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf16P58334 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf16P58334 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf16P58334 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf16P58334 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf16P58334 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf16P58334 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf16P58334 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf16P58334 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf16P58334 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf16P58334 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf16P58334 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf16P58334 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf16P58334 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf16P58334 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf16P58334 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf16P58334 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf16P58334 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf16P58334 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf16P58334 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf16P58334 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf16P58334 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf16P58334 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf16P58334 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf16P58334 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf16P58334 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf16P58334 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf16P58334 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf16P58334 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf16P58334 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf16P58334 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf16P58334 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf16P58334 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf16P58334 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf16P58334 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf16P58334 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf16P58334 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf16P58334 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf16P58334 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf16P58334 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf16P58334 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf16P58334 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf16P58334 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf16P58334 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf16P58334 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf16P58334 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf16P58334 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf16P58334 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf16P58334 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf16P58334 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms