Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dpf3P58269 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dpf3P58269 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Dpf3P58269 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dpf3P58269 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dpf3P58269 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dpf3P58269 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dpf3P58269 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dpf3P58269 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dpf3P58269 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dpf3P58269 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dpf3P58269 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dpf3P58269 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dpf3P58269 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dpf3P58269 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dpf3P58269 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dpf3P58269 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dpf3P58269 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dpf3P58269 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dpf3P58269 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dpf3P58269 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dpf3P58269 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dpf3P58269 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dpf3P58269 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dpf3P58269 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dpf3P58269 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dpf3P58269 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Dpf3P58269 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dpf3P58269 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dpf3P58269 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dpf3P58269 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Dpf3P58269 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dpf3P58269 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dpf3P58269 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dpf3P58269 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dpf3P58269 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dpf3P58269 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dpf3P58269 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dpf3P58269 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Dpf3P58269 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dpf3P58269 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dpf3P58269 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dpf3P58269 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dpf3P58269 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Dpf3P58269 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dpf3P58269 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dpf3P58269 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dpf3P58269 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dpf3P58269 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Dpf3P58269 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dpf3P58269 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dpf3P58269 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dpf3P58269 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dpf3P58269 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dpf3P58269 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dpf3P58269 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dpf3P58269 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dpf3P58269 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dpf3P58269 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dpf3P58269 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dpf3P58269 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dpf3P58269 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dpf3P58269 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dpf3P58269 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dpf3P58269 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dpf3P58269 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dpf3P58269 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dpf3P58269 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Dpf3P58269 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Dpf3P58269 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Dpf3P58269 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dpf3P58269 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Dpf3P58269 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dpf3P58269 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dpf3P58269 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dpf3P58269 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dpf3P58269 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dpf3P58269 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dpf3P58269 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dpf3P58269 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dpf3P58269 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dpf3P58269 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dpf3P58269 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dpf3P58269 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dpf3P58269 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dpf3P58269 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dpf3P58269 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dpf3P58269 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dpf3P58269 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Dpf3P58269 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dpf3P58269 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dpf3P58269 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dpf3P58269 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dpf3P58269 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dpf3P58269 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dpf3P58269 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dpf3P58269 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dpf3P58269 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dpf3P58269 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dpf3P58269 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms