Protein–RNA interactions for Protein: P56581

Tdg, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdgP56581 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TdgP56581 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TdgP56581 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TdgP56581 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TdgP56581 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TdgP56581 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TdgP56581 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TdgP56581 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TdgP56581 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TdgP56581 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TdgP56581 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TdgP56581 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TdgP56581 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TdgP56581 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TdgP56581 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TdgP56581 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TdgP56581 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TdgP56581 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TdgP56581 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TdgP56581 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TdgP56581 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TdgP56581 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TdgP56581 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TdgP56581 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TdgP56581 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TdgP56581 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TdgP56581 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TdgP56581 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TdgP56581 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TdgP56581 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TdgP56581 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TdgP56581 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TdgP56581 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TdgP56581 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TdgP56581 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TdgP56581 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TdgP56581 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TdgP56581 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TdgP56581 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TdgP56581 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TdgP56581 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TdgP56581 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TdgP56581 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TdgP56581 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TdgP56581 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TdgP56581 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TdgP56581 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TdgP56581 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TdgP56581 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TdgP56581 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TdgP56581 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TdgP56581 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TdgP56581 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TdgP56581 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TdgP56581 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TdgP56581 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TdgP56581 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TdgP56581 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TdgP56581 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TdgP56581 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TdgP56581 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TdgP56581 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TdgP56581 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TdgP56581 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TdgP56581 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TdgP56581 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TdgP56581 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TdgP56581 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TdgP56581 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TdgP56581 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TdgP56581 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TdgP56581 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TdgP56581 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TdgP56581 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TdgP56581 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TdgP56581 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TdgP56581 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TdgP56581 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TdgP56581 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TdgP56581 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TdgP56581 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TdgP56581 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TdgP56581 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TdgP56581 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TdgP56581 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TdgP56581 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TdgP56581 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TdgP56581 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TdgP56581 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TdgP56581 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TdgP56581 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TdgP56581 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TdgP56581 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TdgP56581 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TdgP56581 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TdgP56581 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TdgP56581 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TdgP56581 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TdgP56581 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TdgP56581 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms