Protein–RNA interactions for Protein: P55258

Rab8a, Ras-related protein Rab-8A, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab8aP55258 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms