Protein–RNA interactions for Protein: P55097

Ctsk, Cathepsin K, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtskP55097 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CtskP55097 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtskP55097 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtskP55097 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CtskP55097 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtskP55097 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtskP55097 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtskP55097 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtskP55097 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtskP55097 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtskP55097 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtskP55097 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtskP55097 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtskP55097 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtskP55097 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtskP55097 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtskP55097 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtskP55097 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtskP55097 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtskP55097 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtskP55097 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtskP55097 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtskP55097 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtskP55097 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtskP55097 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtskP55097 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CtskP55097 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CtskP55097 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CtskP55097 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CtskP55097 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CtskP55097 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CtskP55097 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtskP55097 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CtskP55097 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtskP55097 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtskP55097 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtskP55097 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CtskP55097 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtskP55097 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtskP55097 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtskP55097 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtskP55097 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtskP55097 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtskP55097 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtskP55097 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtskP55097 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtskP55097 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtskP55097 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtskP55097 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtskP55097 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtskP55097 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtskP55097 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtskP55097 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtskP55097 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtskP55097 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtskP55097 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtskP55097 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CtskP55097 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtskP55097 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtskP55097 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtskP55097 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtskP55097 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtskP55097 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CtskP55097 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CtskP55097 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtskP55097 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtskP55097 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtskP55097 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtskP55097 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtskP55097 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CtskP55097 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtskP55097 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtskP55097 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtskP55097 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtskP55097 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtskP55097 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CtskP55097 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtskP55097 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtskP55097 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtskP55097 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtskP55097 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtskP55097 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtskP55097 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtskP55097 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtskP55097 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtskP55097 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtskP55097 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtskP55097 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtskP55097 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtskP55097 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtskP55097 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtskP55097 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtskP55097 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtskP55097 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtskP55097 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtskP55097 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtskP55097 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtskP55097 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtskP55097 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtskP55097 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms