Protein–RNA interactions for Protein: P54987

Acod1, Cis-aconitate decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acod1P54987 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Acod1P54987 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Acod1P54987 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Acod1P54987 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Acod1P54987 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Acod1P54987 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Acod1P54987 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Acod1P54987 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Acod1P54987 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms