Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rad23aP54726 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rad23aP54726 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rad23aP54726 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rad23aP54726 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rad23aP54726 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rad23aP54726 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rad23aP54726 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rad23aP54726 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rad23aP54726 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rad23aP54726 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rad23aP54726 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rad23aP54726 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rad23aP54726 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rad23aP54726 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rad23aP54726 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rad23aP54726 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rad23aP54726 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rad23aP54726 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rad23aP54726 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rad23aP54726 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rad23aP54726 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rad23aP54726 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rad23aP54726 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rad23aP54726 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rad23aP54726 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rad23aP54726 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rad23aP54726 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rad23aP54726 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rad23aP54726 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rad23aP54726 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rad23aP54726 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rad23aP54726 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rad23aP54726 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rad23aP54726 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rad23aP54726 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rad23aP54726 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rad23aP54726 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rad23aP54726 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rad23aP54726 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rad23aP54726 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rad23aP54726 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rad23aP54726 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rad23aP54726 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad23aP54726 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms