Protein–RNA interactions for Protein: P54099

Polg, DNA polymerase subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolgP54099 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PolgP54099 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PolgP54099 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PolgP54099 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PolgP54099 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PolgP54099 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PolgP54099 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PolgP54099 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PolgP54099 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PolgP54099 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PolgP54099 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PolgP54099 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PolgP54099 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PolgP54099 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PolgP54099 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PolgP54099 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PolgP54099 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PolgP54099 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PolgP54099 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PolgP54099 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PolgP54099 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PolgP54099 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PolgP54099 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PolgP54099 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PolgP54099 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PolgP54099 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PolgP54099 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PolgP54099 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PolgP54099 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PolgP54099 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PolgP54099 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PolgP54099 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PolgP54099 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PolgP54099 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PolgP54099 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PolgP54099 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PolgP54099 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PolgP54099 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PolgP54099 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PolgP54099 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PolgP54099 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PolgP54099 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PolgP54099 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PolgP54099 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PolgP54099 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PolgP54099 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PolgP54099 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PolgP54099 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PolgP54099 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PolgP54099 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PolgP54099 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PolgP54099 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PolgP54099 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PolgP54099 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PolgP54099 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PolgP54099 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PolgP54099 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PolgP54099 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PolgP54099 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PolgP54099 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PolgP54099 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PolgP54099 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PolgP54099 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PolgP54099 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PolgP54099 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PolgP54099 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PolgP54099 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
PolgP54099 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PolgP54099 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PolgP54099 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PolgP54099 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PolgP54099 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PolgP54099 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PolgP54099 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PolgP54099 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PolgP54099 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PolgP54099 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PolgP54099 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PolgP54099 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PolgP54099 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PolgP54099 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PolgP54099 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PolgP54099 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PolgP54099 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PolgP54099 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PolgP54099 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PolgP54099 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PolgP54099 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PolgP54099 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PolgP54099 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PolgP54099 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PolgP54099 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PolgP54099 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PolgP54099 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PolgP54099 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PolgP54099 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PolgP54099 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PolgP54099 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PolgP54099 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PolgP54099 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms